Пользователи системы «Яндекс.Деньги» смогут оплачивать покупки в интернет-магазинах многих стран мира. Это стало возможным благодаря тому, что российская система электронных платежей начала сотрудничать с интегратором платежных сервисов Skrill. Интегратор платежных сервисов Skrill позволяет любому интернет-магазину, пожелавшему работать с российскими пользователями, подключиться к сервису «Яндекс.Деньги». В настоящее время система Skrill насчитывает порядка 140 тысяч интернет-магазинов.
Пока пользователи «Яндекс.Деньги» могут распалиться за покупки в 20 тысячах интернет-магазинах России, Беларуси, Казахстана и Украины. На российской территории это одна из крупнейших платежных систем. По состоянию на начало 2013 года там было зарегистрировано свыше 13 миллионов счетов. Ежедневно проводится более 120 тысяч операций и открывается более 9 тысяч новых счетов.